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雞已感染病毒接種時(shí)雞體內(nèi)已潛伏有強(qiáng)毒病原微生物，只是未表現(xiàn)明顯的臨診癥狀，或接種人員和接種用具帶有強(qiáng)毒病原微生物。
接種時(shí)間不適宜飼養(yǎng)戶難以確定接種疫苗的準(zhǔn)確時(shí)間，其免疫效果也就存在不確切的可能性。如果接種的時(shí)間過早，則會(huì)中和雛雞體內(nèi)的母源抗體，被中和的這些雞疫苗就起不到免疫作用；若疫苗接種的時(shí)間過晚，因雛雞體內(nèi)母源抗體水平低，則可能在預(yù)防接種前已被病毒感染而發(fā)病。
疫苗選用不當(dāng)而引發(fā)疾病例如，雛雞大劑量使用新城疫Ⅰ系疫苗會(huì)導(dǎo)致扭頭、轉(zhuǎn)圈等神經(jīng)癥狀，大劑量使用傳染性喉氣管炎疫苗會(huì)出現(xiàn)流淚、喉頭出血等傳染性喉氣管炎癥狀。
雞接種疫苗后引起不良反應(yīng)例如，雞新城疫Ⅰ系疫苗、雞傳染性支氣管炎疫苗、甘保羅病疫苗的接種，可能造成本來不明顯的敗血性霉?jié){體病的暴發(fā)。因此，當(dāng)雞群中在雞霉?jié){體病潛伏又要進(jìn)行上述疫苗接種時(shí)，應(yīng)考慮提前1-2天給免疫接種的雞連續(xù)服用藥物，以便減輕或防止?jié)摲膊〉谋┌l(fā)。
疫苗使用技術(shù)錯(cuò)誤近年來常用的法氏囊滅活疫苗的使用方法一般有兩種：一種是混在水里通過飲水進(jìn)行接種，另一種是通過滴服法進(jìn)行接種。有些養(yǎng)雞戶將兩種方法混為一談，往往圖省事，把本來應(yīng)該滴服接種的疫苗改為飲水接種，因其使用方法不當(dāng)導(dǎo)致免疫失敗。另外，有的養(yǎng)雞戶雖然利用飲水接種疫苗的方法正確，但因使用的自來水帶有消毒藥，或者使用金屬類飲水器，或者停水時(shí)間不當(dāng)，或者疫苗飲水時(shí)間過長（超過兩小時(shí)）等，造成疫苗效價(jià)降低，從而影響了免疫效果。
不同種類疫苗間的相互干擾作用一個(gè)養(yǎng)雞場可能不止進(jìn)行一種疫苗的免疫接種，往往幾種疫苗同時(shí)使用。例如，有的養(yǎng)雞戶同時(shí)給雞接種雞新城疫Ⅰ系疫苗和雞痘疫苗。由于雞新城疫Ⅰ系苗具有很強(qiáng)的干擾作用，可導(dǎo)致雞痘疫苗免疫失敗，從而有可能發(fā)生雞痘。另外對最流行的傳染病，為了保證免疫效果，最好單獨(dú)接種，以便產(chǎn)生很強(qiáng)的免疫力。